有機肥發酵原理槽式發酵：它利用生物學特性結合機械化技術，利用自然微生物或接種微生物將牛糞完全腐熟并將有機物轉化為有機質、二氧化碳與水，這種方法發酵時間短，一般15天左右就能使牛糞完全發酵腐熟，而且易實現工廠化規模生產，不受天氣季節影響，對環境造成的污染小，有利于牛糞有機肥的商品化生產。根據設備不同，發酵槽的寬度一般為3-20m，深度一般為0.8-1.5m，長度在50～100 m，可據實際情況設計。 條垛式發酵：條垛式堆肥是將原料混合物堆成長條形的堆或條垛，通過人工或機械的定期翻堆配合自然通風來維持堆體中的有氧狀態，在好氧條件下進行發酵分解。垛的斷面可以是梯形、不規則四邊形或三角形。條垛式堆肥發酵是將物料鋪開成行，在露天或棚架下堆放，每排物料寬2-3 m，高1-1.5m左右，長度根據實際情況而定，物料堆下面可裝置通氣管道，也可不裝通氣設施。 發酵相關條件 1、含水量：污泥物料的含水量一般保持在65—75% ，含水量過大，物料間隙含氧不能滿足微生物菌對氧的需求初期發酵須采用沃特威“基質發酵法”工藝。

　　2、氧量和溫度：好氧堆肥的實際通風時間根據堆溫測量控制。初期可以減少翻堆次數有利于堆溫升高，當溫度升高到70攝氏度左右時，要及時翻堆，使堆溫不至于超過70攝氏度。70攝氏度以上時，一些微生物呈孢子狀態，發酵劑功能微生物的活性幾乎為零。

　　3、pH值：在堆肥過程中，物料的Ph值會隨著發酵階段的不同而變化， Ph值在5.5—7.5之間對堆肥無大影響，偏離此范圍，要對物料進行調節。

　　4、C/N比：一般控制在25左右，不合適要摻入其它他物料調節。

　　5、團粒度：用設備控制在15—30毫米為宜，隨物料發酵進程團粒度變小。